Централизованные подразделения  являются  структурными  отделениями ФГАУ «НМИЦ здоровья детей» Минздрава России, имеющими важнейшее значение для выполнения Центром социальных и информационных функций. Многогранная деятельность этих подразделений направлена на реализацию  заданий государственной программы научных исследований в педиатрии, разработку  новых  методов оптимизации и организации детского здравоохранения в стране, создание современных клинических рекомендаций и их внедрение в практику медицинской помощи детям, проведение мероприятий, направленных на профилактику бедности и жестокого обращения с детьми, налаживание взаимоотношений между общественными организациями и фондами для оптимизации медико-социальной помощи больным детям и их семьям.